本省内部部局
観光庁
海難審判所
国土技術政策総合研究所（つくば）
国土技術政策総合研究所（横須賀）
国土交通大学校
国土地理院
東北地方整備局
東北地方整備局（港湾空港）
関東地方整備局
関東地方整備局（港湾空港）
北陸地方整備局
北陸地方整備局（港湾空港）
中部地方整備局
中部地方整備局（港湾空港）
近畿地方整備局
近畿地方整備局（港湾空港）
中国地方整備局
中国地方整備局（港湾空港）
四国地方整備局
四国地方整備局（港湾空港）
九州地方整備局
九州地方整備局（港湾空港）
北海道開発局
北海道運輸局
東北運輸局
関東運輸局
北陸信越運輸局
中部運輸局
近畿運輸局
神戸運輸監理部
中国運輸局
四国運輸局
九州運輸局
東京航空局
大阪航空局
気象庁本庁
気象研究所
気象衛星センター
札幌管区気象台
仙台管区気象台
東京管区気象台
大阪管区気象台
福岡管区気象台
沖縄気象台
運輸安全委員会
海上保安庁本庁
海上保安大学校
海上保安学校
第一管区海上保安本部
第二管区海上保安本部
第三管区海上保安本部
第四管区海上保安本部
第五管区海上保安本部
第六管区海上保安本部
第七管区海上保安本部
第八管区海上保安本部
第九管区海上保安本部
第十管区海上保安本部
第十一管区海上保安本部
